现代农学院围绕产业需求设有现代牧业技术系和现代农林技术系。开设现代畜牧1个本科，设专业现代农业技术、园林技术、动物医学、畜牧兽医、宠物医疗技术5个高职专业。吉林省特色高水平专业群1个，长春职业技术学院现代学徒制2个。
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